Původní románský kostel byl po několika pohromách, zejména požárech, kolem roku 1320 přebudován v gotický trojlodní kostel, v roce 1733 byla Mořicem Grimmem dokončena barokizace celého objektu. V té době vznikly významné stavby kláštera – Loreta a Svaté schody. V roce 1784 došlo k přeměně klášterního chrámu na farní kostel.
Minoritský řád je jediný, který působí v Brně téměř osm století na jednom místě. Pamětní deska na průčelí vedle vchodu do chrámu připomíná, že zde působil také moravský národní buditel, sběratel národních písní, básník, profesor František Sušil (1804-1868).
